Майкл Фассбендер родился 2 апреля 1977 года в небольшом немецком городке Хайдельберге. Его отец этнический немец, мать родом из Ирландии. По материнской линии его родословная ведет к знаменитому ирландскому революционеру Майклу Коллинзу. В 1979 году, когда Майкл был еще совсем маленький, его семья переезжает в город Килларни. Отец Майкла открывает небольшой ресторан, где сам и работает шеф-поваром. Еще в детстве мальчик начал активно заниматься музыкой, научился играть на гитаре, аккордеоне и пианино. Став старше, Майкл поступает в Лондоне в театральную школу и успешно заканчивает ее.

Актерская карьера Майкла Фоссбендера начинается с популярного мини-сериала Тома Хэнкса и Стивена Спилберга «Братья по оружию» 2001 года, где он сыграл роль сержанта Бёртона Кристенсона. После этого он продолжает играть в различного рода телесериалах и фильмах для телевидения. В 2007 году он получает роль в фильме «Ангел» о судьбе влюбленной писательницы, дебютировавшем на Британском кинофестивале. Настоящим успехом для него стала съемка в популярной голливудской экранизации «300 спартанцев». Несмотря на то, что у Майкла роль была далеко не главной, его заметили голливудские кинодеятели. Предложения посыпались одно за другим.

В 2008 году он снимается в дебютном фильме Стива МакКуина «Голод», за который получает несколько престижных кинопремий. Специально для этого фильма Майкл Фассбендер садится на специальную диету, чтобы соответствовать образу. В итоге при росте 183 см он весил всего 58 кг. Такое самопожертвование ради искусства не остается незамеченным.

Вскоре Майкл Фассбендер снимается в «Бесславных ублюдках» Квентина Тарантино и «Центурионе» с Ольгой Куриленко. Голливуд принял нового актера в свои ряды. Вскоре Майкл снимается в роли Магнето в «Людях Икс» и в экранизации знаменитого романа «Джен Эйр».

Как актера Майкла Фоссбендера часто упрекают в неприметности и отсутствии яркой индивидуальности. Обладая красивой внешностью и незаурядным талантом к перевоплощению, Майкл зачастую оказывается неузнаваемым в каждом новом фильме. Это, отчасти, негативно сказывается на его популярности среди зрителей, но обеспечивает ему любовь режиссеров и продюсеров по обе стороны океана. Мастерство актера было неоднократно отмечено множеством номинаций и наград кинопремий всего мира.

Закулисная жизнь актера иногда также выплывает наружу. Так, в 2010 году бывшая девушка Майкла подала на него в суд с требованием выпустить запрет на приближение к ней ближе, чем на 100 метров. Также она потребовала 15 тысяч евро в качестве компенсации морального вреда и медицинских расходов за избиение. До суда дело не дошло.

На съемках фильма «Люди Икс» Майкл Фоссбендер сдружился с Джеймсом МакЭвоем. Вместе они устраивали различные хулиганские поступки и однажды на полном ходу на гольф-каре врезались в припаркованный автомобиль. К счастью, никто не пострадал.

В 2012 году Майкл Фассбендер подписал контракт на главную роль в фильме по мотивам популярной компьютерной игры Assassin’s Creed.