Синтия Эллен Никсон родилась в центре Нью-Йорка, в Манхэттене 9 апреля 1966 года. Синтия была единственным ребенком и после развода родителей осталась с матерью. Энн Никсон, ее мать, была театральной актрисой. Уолтер Никсон, ее отец, был радиожурналистом.Никсон получила свою первую роль в 12 лет, а в 15 получила первую театральную премию, в 18 сыграла сразу две главных роли в популярных бродвейских мюзиклах.

В 1980 году состоялся ее кинодебют. Она сыграла в таких картинах, как: «Король города», «Амадей», «Младенец на прогулке», «Комната Марвина», «Дело Пеликанов», «Приезжие», «Любовь, которую она искала», «кис-кис, крошка!», «Пятое июля», «Лицо незнакомца», «Убийство Мэри Фейган».Но мировую известность Синтия получила после роли в сериале «Секс в большом городе». Она считает себя самой большой фанаткой данного сериала, и говорит, что сама напросилась на роль.Синтия состояла в гражданском браке с 1998 по 2003 год с Дэнни Мозесом (английский профессор). В браке у них родилось двое детей: Дочь Саманту (1996) и сына Чарльза (2002). Но напряженный рабочий график разрушил их брак.С 2004 года и по сегодня Никсон встречается с женщиной Кристин Маринони (активистка образовательного движения). Они объявили о помолвке в 2009 году. Кристин родила сына в феврале 2011 года. Мальчика назвали Макс Эллингтон Никсон-Маринони.